La UNICEN impulsa la conformación y el desarrollo de clusters o conglomerados empresariales en sectores o campos de actividad en donde la Universidad cuenta con una importante masa crítica de capacidades ya desarrolladas. Un primer emprendimiento de esta naturaleza comenzó a gestarse en diciembre del 2003 con el fuerte compromiso institucional de la UNICEN y de un importante número de empresas productoras de software y servicios informáticos. El Polo Informático se convirtió en un hito fundamental de la historia de la vinculación tecnológica de la UNICEN, afianzando las sinergias e intercambios productivos entre miembros de la empresa y de la comunidad universitaria en un marco de cooperación mutua y permanente que facilita la construcción de redes de innovación y entrepreneurship. Otros campos de actividad con fuerte tradición en la investigación científica y tecnológica (tales como física de materiales, y producción y sanidad agropecuaria) han comenzado a transitar caminos similares tendientes a la conformación y desarrollo de clusters tecnológicos. A la fecha la universidad cuenta con tres clusters sectoriales, a saber: 1) Polo Informático, 2) Polo Agropecuario-Industrial, y 3) Polo de Materiales de Avanzada.